Postdoktor inom multiomik, maskininlärning cancerbiologi

Arbetsbeskrivning

Vi är en del av SciLifeLab and Wallenberg National Program for Data-Driven Life Science (DDLS) strategiska område Precision Medicine and Diagnostics och är verksam vid SciLifeLab och KTH. Gruppens forskningen kombinerar cancerbiologi, multiomik och beräkningsbaserade metoder, med en stark forskningsprofil inom tvärvetenskaplig forskning och publikationer i ledande vetenskapliga tidskrifter. Mer information om gruppen finns på: A Lundberg Lab.

Vi kommer att integrera flera datatyper, inklusive genomik, transkriptomik, DNA-metylering, andra molekylära profiler, kliniska och patologiska data samt medicinska bilder, med särskilt fokus på att utveckla tolkningsbara och biologiskt meningsfulla modeller. Metoderna kan omfatta maskininlärning, deep learning, bildanalys, beräkningsbaserad patologi, multiomikintegration och foundation models.

Anställningen passar någon med stark beräkningsvetenskaplig bakgrund och dokumenterad erfarenhet av maskininlärning, deep learning eller närliggande områden, i kombination med ett intresse för cancerbiologi och biomedicinska tillämpningar. Det finns även möjlighet att bidra till forskningsansökningar, forskningsnätverk. Den som anställs kommer att ges möjlighet att utveckla och leda egna beräkningsbaserade forskningsprojekt inom gruppen.

Kvalifikationer

Krav

Avlagd doktorsexamen inom datavetenskap, maskininlärning, beräkningsbiologi, bioinformatik eller närliggande område. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

En stark forskningsprofil inom maskininlärning, deep learning, beräkningsbiologi eller närliggande beräkningsvetenskapliga områden, med dokumenterat intresse för att tillämpa beräkningsbaserade metoder inom cancerforskning eller annan biomedicinsk forskning.

Programmeringskunskaper i Python och/eller R samt erfarenhet av att utveckla, implementera och utvärdera beräkningsbaserade metoder eller maskininlärningsmetoder.

Goda kunskaper inom statistik, biostatistik och multivariat dataanalys, inklusive lämpliga metoder för modellevaluering och validering.

Mycket goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift, eftersom engelska används i det dagliga arbetet.

Erfarenhet av:

Storskaliga, högdimensionella biologiska eller biomedicinska dataset och integration av heterogena datatyper.

Ett eller flera av följande områden: analys och integration av multiomikdata, multimodal maskininlärning, medicinsk bildanalys, beräkningsbaserad patologi, bildanalys, integration av biologiska datatyper eller foundation models.

Unix/Linux-miljöer och högpresterande beräkningssystem.

Vetenskapligt skrivande, vetenskapliga publikationer och/eller forskningsansökningar.

Meriterande

Vid sista ansökningsdag högst tre år sedan doktorsexamen.

Erfarenhet av:

Att utveckla tolkningsbara eller förklarbara maskininlärningsmodeller.

Att tillämpa maskininlärning inom cancerbiologi, cancergenomik eller precisionsmedicin.

Storskaliga publika eller kliniska dataset

Att vara självständig utveckling av forskningsprojekt.

Undervisning, mentorskap eller handledning.

Välutvecklad analytisk förmåga och problemlösningsförmåga.

Förmåga att arbeta effektivt i en tvärvetenskaplig och samarbetsinriktad forskningsmiljö.

Ett strukturerat och organiserat arbetssätt.

Medvetenhet om mångfalds- och lika villkorsfrågor, med särskilt fokus på jämställdhet.

Vi kommer att lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Bli en del av KTH

KTH formar framtiden genom utbildning, forskning och innovation. Som ett ledande internationellt tekniskt universitet spelar vi en aktiv roll i att driva och medverka i omställningen till ett hållbart samhälle. Här erbjuds du möjligheten att växa och utvecklas på en kreativ och dynamisk arbetsplats med goda arbetsvillkor och förmåner. Jämställdhet, mångfald och lika villkor är en kvalitetsfråga och en självklar del av KTH:s värdegrund som universitet och statlig myndighet.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att arbeta och utvecklas på KTH.

Fackliga representanter

Kontaktuppgifter till fackliga representanter.

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska innehålla:

CV, inklusive relevant yrkeserfarenhet och kompetens.

Kopior av examensbevis och betyg från tidigare universitetsstudier. Om originalhandlingarna inte är utfärdade på svenska eller engelska ska de åtföljas av översättningar till svenska eller engelska.

En kort beskrivning av varför du vill bedriva forskning i A. Lundberg Lab, dina akademiska intressen samt hur dessa relaterar till dina tidigare studier och framtida karriärmål. Beskrivningen ska vara högst två sidor lång.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time).

Om anställningen

Anställningen gäller tillsvidare, dock längst två år

En anställning som postdoktor är en tidsbegränsad meriteringsanställning med huvudinriktning mot forskning avsedd som ett första karriärsteg efter disputation.

Övrigt

För information om behandling av personuppgifter i samband med rekrytering.

Det kan förekomma att en anställning hos KTH är placerad i säkerhetsklass. Om så är fallet för just denna anställning görs en säkerhetsprövning av sökande i enlighet med säkerhetsskyddslagen (2018:585) efter samtycke. I dessa fall är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd efter säkerhetsprövning.

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.